沼氣冷凝器循環水冷卻水在水制冷系統中，熱交換器中隨時存在溶解鹽形成水垢沉淀物；暴露在空氣中的水會捕捉空氣中的微粒（沙子，樹葉，灰塵，煙灰等），這會導致生物膜和沉淀物的產生，迅速結垢，從而地降低熱交換器的效能。研究表明冷凝器管一層0.1~0.5毫米厚的水垢會降低機組熱傳輸30%左右的效能，以及增加15%以上的能源消耗。同時壓縮機被迫更辛苦地工作。生物膜形成的結垢更加嚴重，因為它是水垢熱阻滯效果的5倍。定期手工清洗冷凝器管只是臨時的措施，一旦中央空調恢復運作，結垢會馬上再次形成。此外，工廠停工會遭受更嚴重的成本損失。因為有腐蝕作用的材料被用于清潔，所以冷凝管磨損，降低機組的壽命。

一、對冷水機組效率的影響

現有的中央空調水系統絕大部分是采用開式冷卻塔對冷卻水進行降溫， 水系統通過冷卻塔與空氣接觸，負壓的工作原理容易導致冷卻水中吸入大量的粉塵和微生物，加上常年二三十攝氏度的水溫，久而久之在 水系統中產生和積累大量的粘泥和微生物等，會在冷凝器的換熱管（鐵或者銅材質）表面形成污垢（主要成分是碳酸鈣、碳酸鎂）， 使冷凝器的傳熱惡化、效率降低。 

二、傳統的冷水主機冷凝器中污垢的解決方法

為了防止冷凝器管壁結垢，我們采用化學水處理，通常會在水系統中投加緩蝕劑、阻垢劑及殺菌滅藻劑等幾種藥劑。緩蝕劑可在金屬表面形成保護膜，防止管壁腐蝕；阻垢劑作用于形成垢的成分碳酸鈣等的結晶體，使其扭曲、錯位、變形，達到妨礙垢生長的目的；殺菌滅藻劑對藻類和細菌有抑制作用，防止其繁殖產生微生物粘泥。